Ang paghahayupan ay isang uri ng negosyo na maaaring kumain ng malaking kapital, panahon, at tiyaga. Sa kabila ng malaking kinikita sa negosyong ito, maraming mga suliranin pa rin ang nakakasalubong nito. Ang ilan sa mga kadalasang suliraning kinakaharap ng paghahayupan ay ang mga sumusunod:
1. Kakulangan sa lupa
2. Sakit at pagbabakuna
3. Gastos sa pagpapakain
4. Pagkamatay ng mga alagang hayop
At iba pa.